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種間伝播モデル:3つの集団間の病気の伝播 📂動力学

種間伝播モデル:3つの集団間の病気の伝播

概要

種間障壁species Barrierとは、病原体がもとの宿主から他の種に感染するのが難しい現象を言う。この種間障壁を超えて病気が感染することを種間伝染cross-species Transmissionと呼んでおり、これを数学的にモデリングしたホスト-ベクター-ホストモデルhost-vector-host modelを紹介する。

モデル 1

dI1dt=β12I2S1γI1dI2dt=(β21I1+β23I3)S2γI2dI3dt=β32I2S3γI3 \begin{align*} \\ {{d I_{1}} \over {d t}} =& \beta_{12} I_{2} S_{1} - \gamma I_{1} \\ {{d I_{2}} \over {d t}} =& \left( \beta_{21} I_{1} + \beta_{23} I_{3} \right) S_{2} - \gamma I_{2} \\ {{d I_{3}} \over {d t}} =& \beta_{32} I_{2} S_{3} - \gamma I_{3} \end{align*} ただし、k=1,2,3k=1,2,3に対してSk+Ik=1S_{k} + I_{k} = 1である。


  • SkS_{k}に対する微分方程式はわざと書かなかったが、本来は明示的に全部書くべきである。

変数

  • Sk(t)S_{k}(t): tt時点で病気にかかることができるsusceptiblekk番目の集団の比率を表す。
  • Ik(t)I_{k}(t): tt時点で病気を伝染させることができるinfectiouskk番目の集団の比率を表す。情報の広がりの文脈では、Informedの頭文字を取ることもある。

パラメータ

  • βij>0\beta_{ij}>0: ii集団に対するjj集団の感染率infection rateである。
  • γk>0\gamma_{k}>0: kk集団の回復率recovery rateである。

説明

基本的にSISモデルを使っているが、何でもかんでもだが、重要なのは全体の人口を二つの集団k=1,2,3k=1,2,3に分けたということだ。インデックス1,31,3宿主hostと見たとき、二つの集団は直接的に病気を伝え合うわけではないが、インデックス22中間宿主vectorを通じて伝染病を共有している。

2021年にもまだ議論があるCOVID-19は、コウモリから始まり、チョウゾウカブトを通じて人間に伝播されたと見られており2I1I_{1}がそのウイルスを持っていたコウモリならば、I2I_{2}はチョウゾウカブトであり、最初のI3I_{3}はそれを薬や高級食材として楽しんでいた武漢の中国人だったろう。

種間伝染の話ではないが、状態の区画だけでなく、複数の種レベルの区画設定はより多くの可能性を開く。同じ種内でも、空間的な特性(例えば国レベルでの)を反映させるとか、年齢/生活パターンの違いによる接触量が異なることを仮定して感染率に差をつけるという方法も考えられる。